Palvelut

CSC:n palvelut tutkijoille

CSC-Tieteen tietotekniikan keskus Oy operoi ELIXIR Suomen solmupistettä ja tarjoaa kattavan kokonaisuuden tieteellisen laskennan, datahallinnon- ja analyysin palveluja ja ratkaisuja biolääketieteen tutkijoille. Useimmat palveluista ovat ilmaisia suomalaisille yliopistojen tutkijoille, mutta yleensä CSC:n käyttäjätunnus vaaditaan.

• CSC:n palvelut tutkijoille
• Palveluihin pääsy
• Yleiset CSC:n palveluiden käyttöehdot
• Resursseja erityisesti bio- ja terveysalan tutkijoillemme
• CSC:n arkaluontoisen aineiston palvelut

ELIXIR Suomen palveluita myös kansainvälisille tutkijoille

CSC:n palvelut ovat suomalaisissa tutkimusorganisaatioissa kirjoilla olevien tutkijoiden käytettävissä. Tämän lisäksi ELIXIR Suomi tarjoaa palveluita kansainvälisille käyttäjille ELIXIR-sopimuksen perusteella seuraavasti:

Laskenta

• REMS (Resource Entitlement Management System) on työkalu, jonka avulla voidaan hallinnoida tutkijoiden käyttöoikeuksia bioinformatiikan tietokantoihin.
• ELIXIR AAI – Tunnistautuminen ja valtuutus

• ELIXIR Commissioned Infrastructure Service with ELIXIR CZ

• • Eurooppalaiset identiteetti- ja käytönhallintapalvelut (ELIXIR AAI) useiden eri organisaatioiden ja tuhansien tutkijoiden käyttöön, tuotettu Suomen ja Tsekin ELIXIR-keskuksien yhteistyönä.

Koulutus

ELIXIR Suomen keskus CSC järjestää bioinformatiikan, tieteellisen laskennan, datanhallinnan, identiteetin ja pääsynhallinnan teknologioiden sekä tietoverkkojen koulutusta. Kansainväliset tutkijat voivat osallistua ELIXIR Suomen keskuksen tarjoamiin koulutuksiin. Löydät CSC:n järjestämät koulutukset täältä:

CSC:n koulutuskalenteri

ELIXIR koulutusportaali TeSS kokoaa eri ELIXIR-keskusten ja muiden koulutustarjoajien biotieteiden koulutusresurssit yhteen.

ELIXIR koulutusportaali TeSS

Data-analytiikka

Chipster on käyttäjäystävällinen analyysiohjelmisto suurikapasiteettiselle (high-throughput) datalle, kuten yksittäisen solun RNA-sekvensoinnille. Chipster-alusta sisältää yli 400 analysointityökaluja ja laajan kokoelman referenssidataa. Käyttäjät voivat tallentaa ja jakaa automaattisia analyysiputkia, sekä visualisoida dataa interaktiivisesti.

Muut ELIXIR-resurssit

• ELIXIR koordinoi ja kehittää life science -palveluita kaikkialla Euroopassa. Hae, selaa teemojen mukaan ELIXIR-Europe Services tai katso täydellinen luettelo palveluista.
• ELIXIR Research Data Management Kit (RDMkit) on online-opas, joka opastaa hyviä datanhallintakäytäntöjä sovellettavaksi tutkimusprojektien alusta loppuun. Osana RDMkit-työkalua löydät koosteen CSC:n tarjoamista datanhallinnan palveluista  CSC data management tool assembly and national resources page of Finland.