Eurooppalanen genomidatan infrastruktuuri (GDI) mahdollistaa tutkijoiden pääsyn eurooppalaiseen genomidataan ja kliiniseen dataan. Tavoitteena on parantaa diagnostiikkaa ja farmakogenomiikkaa eli toisin sanoen perintötekijöiden yksilöerojen vaikutusta lääkevasteeseen. Toinen tavoite on tukea tutkimuksessa käytettävän datan toisiokäyttöä. Arvokasta dataa kerätään potilasaineiston perusteella syövistä, harvinaisista ja polygeenisistä (monitekijäisistä) sairauksista. Aineistoa on saatu myös sairautta aiheuttavista patogeeneistä sekä infektiotaudeista, kuten esimerkiksi COVID-19-viruksesta.
CSC:llä yhtenä infrastruktuuri-pilarin vetäjistä on johtava rooli tässä työssä. Myös Life Science AAI (Authentication and Authorization Infrastructure) ja REMS (Resource Entitlement Management System ) ovat sovelluksia, jotka ovat jo käytössä tukemassa dataan pääsemisen hallinnassa. GDI:n rakentamisen pohjaksi on luotu Starter Kit. Starter Kit sisältää yli 2500 synteettistä genomia ja fenotyyppistä dataa syövästä ja harvinaisista sairauksista. Se on ensimmäinen askel kohti tuotanto-infrastruktuuria.
Lue lisää täältä
ELIXIR is partly funded by the European Commission