Suomen ELIXIR keskus CSC rakentaa yhdessä Linköpingin ja Uppsalan yliopistojen kanssa patologisen datan tietokannan sisältäen turvallisen luvittamismekanismin patologisten kuvien ja niitä kuvailevien tietojen vastaanottamiseksi ja tallentamiseksi. Datan kuvailulla on keskeinen osa myös sen luvituksessa. BIGPICTURE nojaa ELIXIR AAI:n teknologioihin kuvantamisdatan luvittamisessa. Hankkeeseen osallistuvat organisaatiot ovat lupautuneet tuottamaan ja jakamaan kuvadataa.
Helmikuussa 2021 alkanut kuusivuotinen BIGPICTURE -projekti kerää kolme miljoonaa skannattua ja digitalisoitua patologian kuvaleikettä Euroopan eri sairaaloista, tutkimusorganisaatioista ja lääkealan yrityksistä.
BIGPICTURE on eurooppalainen yhteenliittymä, jonka tarkoituksena on luoda tietoturvallinen ja eurooppalaista tietosuojaa noudattava tallennuspaikka ja alusta. Alustalle voi tallentaa kokonaisia mikroskooppileikekuvia sekä koneoppimisen algoritmeja, joiden ansiosta kuvien analysoiminen tekoälyn avulla onnistuu.
Hankkeeseen osallistuu 45 organisaatiota 15 maasta. Suomesta mukana on Helsingin yliopistollinen sairaala HUS ja erityisesti Helsingin Biopankki sekä CSC – Tieteen tietotekniikan keskus.
Lue lisää täältä
CSC – Tieteen tietotekniikan keskus Oy
on valtion omistama, opetus- ja kulttuuriministeriön hallinnoima, voittoa tavoittelematon osakeyhtiö. CSC ylläpitää ja kehittää valtion omistamaa keskitettyä tietotekniikkainfrastruktuuria.
ELIXIR
rakentaa infrastruktuurin bioalan tutkimuksen tueksi. Se yhdistää 21 Euroopan maan ja Euroopan molekyylibiologian laboratorion EMBL:n johtavat organisaatiot yhteiseksi biologisen informaation infrastruktuuriksi. Sen Suomen keskus on CSC – Tieteen tietotekniikan keskus Oy.
ELIXIR is partly funded by the European Commission