23.6.2025Liian puhdas on epäterveellistä
8.5.2025Puiden kuorista eristetyt alkaloidit tuhoavat syöpäsoluja
27.3.2025Vinka-alkaloidit: Madagaskarin lahja syövän torjuntaan
6.2.2025Geneettinen testaus parantaa lääkehoitoja
26.12.2024ComPatAI-konsortio hyödyntää suuria datamääriä oppivan tekoälymallin luomiseksi patologiaan
14.11.2024Mikrobisto vaikuttaa immuunijärjestelmään
21.10.2024Ihon monipuolinen mikrobisto auttaa immuunipuolustusta
30.9.2024RNA:ta sitovista proteiineista uusia lääkekohteita
31.8.2024Uusi koneoppimisen menetelmä nopeuttaa lääkeaineiden seulontaa satakertaisesti
22.7.2024Kahvin perimän selvittäminen parantaa taudinkestävyyttä
25.6.2024Miksi jotkut sairastuvat vaikeaan koronavirustautiin?
30.5.2024Terveysdataa ymmärtävä tekoälymalli varoittaa tulevista sairauksista
29.4.2024Genomidatalle infrastruktuuri
1.4.2024Euroopan tutkimusyhteisö valmistautuu seuraavaan pandemiaan
8.3.2024Virusten ja muiden mikrobien evolutiikka vaikuttaa ihmisen terveyteen
2.3.2024Euroopan miljoona genomia
20.2.2024Biologisen kuvadatan siirtäminen ja analysoiminen tehokkaasti web-käyttöliittymien avulla
23.1.2024Rintasyövän hoitoennuste paranee nestebiopsian avulla
15.12.2023Euroopan terveysdata-avaruus: terveysdata liikkuu tutkimuskäyttöä varten yli rajojen
16.11.2023Suolistomikrobien toimintaa mitataan uudella menetelmällä
31.10.2023Kasvien mikrobikumppanit kaivosjätteiden puhdistajana
29.9.2023Tekoäly etsii sopivan lääkeaineen geenidatasta ja syöpäsolunäytteistä
1.9.2023Dataa eri lähteistä yhdistämällä saadaan yksilöllisiä hoitoja
15.8.2023Leukemiaan parempia hoitoja
10.6.2023Mikro-RNA:t voivat paljastaa nuoruusiän diabeteksen
16.5.2023Yksittäisen solun sekvensointitekniikka mahdollistaa sairauksien yksilöllisen hoidon
12.4.2023Kudosnäytteet, jotka on analysoitu sensitiivisen datan (SD) palveluilla, antavat uutta tietoa keliakiasta ja muista autoimmuunisairauksista
20.3.2023Itämeren sedimenteistä eristetyt DNA:t auttavat tutkimaan ilmastonmuutosta ja biodiversiteettiä
27.2.2023Kantasoluista kasvatetut organoidit tehostavat syöpätutkimusta
19.12.2022Sensitiivisen datan palvelut tutkimukselle: muutamalla klikkauksella tutkija voi käynnistää turvallisen ja henkilökohtaisen laskentaympäristön
30.11.2022Ikiroudan alta paljastui mikrobiyhteisöjä, joilla on merkittävä rooli ilmastonmuutoksessa
20.10.2022Uudelleenkäytettävää, oikein kuvattua ja laadukasta dataa – tutkijayhteisön luomia työkaluja ketterään datanhallintaan
29.9.2022Valtamerien mikrobiyhteisöjen rakennetta ja toimintaa selvitetään geenisekvensoinnin avulla
1.9.2022Antibiooteille vastustuskykyiset bakteerit ovat maailmanlaajuinen ongelma
23.8.2022Yksilöity lääketiede syövän ja virusten torjunnassa
30.6.2022Ihmisen mikrobiomin tutkiminen on avain terveyden kokonaisvaltaiselle ymmärtämiselle
23.5.2022FINRISKI: yksi maailman pisimmistä väestötutkimuksen aikasarjoista
8.4.2022Biopankkien ja terveysrekisterien tiedon yhdistäminen mahdollistaa personoidun hoidon kehittämisen
3.3.2022Suomessa sekvensoidaan tuhansien diabetes-potilaiden koko perimä ja etsitään geneettisiä riskitekijöitä
10.2.2022BIGPICTURE mahdollistaa patologian muuttumisen digitaaliseksi
30.12.2021Sensitiivisen datan infrastruktuuri
23.11.2021Tulevaisuudessa algoritmi voi tunnistaa glaukooman silmänpohjakuvista
26.10.2021Potilasdatan ansiosta saadaan entistä parempia tekoälymalleja
16.9.2021Algoritmi opetetaan tunnistamaan syöpä sekvenssidatasta
3.12.2020Tehokas datan prosessointi ja jakaminen parantaa sairauksien tunnistamista ja hoitoa
10.11.2020Bioinformatiikka mullistaa terveydenhuollon: Datan tehokas käsittely nopeuttaa diagnooseja ja mahdollistaa yksilölliset lääkehoidot
27.8.2020Kudosnäytteet digitaalisiksi kuviksi ja tekoäly tulkitsemaan
9.6.2020Digitaalinen patologia nopeuttaa diagnosointia
18.5.2020Koneoppimisella etsitään merkkejä rintasyövästä
8.4.2020Metabolomiikka mittaa ja analysoi sairauden, ruokavalion tai lääkityksen aiheuttamia muutoksia aineenvaihdunnassa
1.3.2020Syväoppimisalgoritmit auttavat rintasyövän seulonnassa
13.2.2020Rintasyövän kaikkia riskitekijöitä arvioidaan tekoälyn avulla
6.2.2020Koira haistaa sairauksia
2.12.2019ELIXIR Compute Platform -laskentaympäristö bio- ja terveystieteille
18.11.2019Bioinformatiikan uudet menetelmät ja tekniikat edellyttävät jatkuvasti päivittyvää kurssitarjontaa ja analyysiohjelmistoja
30.10.2019Käyntiä tiskillä ei tarvita: SisuID tehostaa sähköistä tunnistamista
30.9.2019Sydän- ja verisuonitautien riskiarviointi kaikille kansalaisille
4.9.2019Verisuonten mallintamisella täsmähoitoa laskimosairauksiin
20.8.2019Federoitu käyttäjähallinta: yhdellä tunnistautumisella lukuisiin bioinformatiikan palveluihin
4.7.2019Harvinainen geeniperimä auttaa löytämään yleisiä tauteja ohjaavia mekanismeja
3.6.2019VEIL.AI: potilastietoja hunnutettuina
20.5.2019Biocenter Oulu: teknologiapalveluja biolääketieteelliseen tutkimukseen
23.4.2019Hiirimalleista apua ihmisten tautien syntymekanismien selvittämiseen
4.3.2019Euro-BioImaging: kuvantamisen infrastruktuuri
26.2.2019Kuvantaminen auttaa havainnoimaan datan merkitystä
14.1.2019Datan harmoniaa ja standardeja: aineistot pitää käsitellä, kuvailla ja tallentaa samalla tavoin
10.12.2018Sadat geenit voivat olla yksittäisen taudin taustalla
5.11.2018Suomalaisen väestön perimästä apua sydän- ja verisuonisairauksien hoitoon
8.10.2018Sairauksien ennustemallit tarkentuvat laskennallisten menetelmien ansiosta
11.9.2018Geenidata haltuun ja haluttuun muotoon
23.8.2018Massiivinen datanhallintaprojekti: suomalaisten perimä kerätään talteen
14.6.2018Puolet lääkeaineista vaikuttaa vain kolmeen proteiiniperheeseen
12.6.2018Hyvää lääkeainemolekyyliä etsimässä
29.5.2018Potilasnäytteistä nopea DNA-analyysi tekoälyn avulla
7.5.2018Suoliston salaisuudet
4.4.2018Algoritmi määrittää sopivan lääkkeen
19.3.2018Miljoonan potilasnäytteen pankki
20.2.2018Kaikkien eliöiden perimän selvittäminen mahdollistaa uusia rokotteita ja lääkkeitä
7.2.2018Tilattu ja lukkojen takana
2.11.2017Tavoitteena kansallinen palvelu perimästä saadun datan hyödyntämiseen terveydenhuollossa
11.8.2017Parempaa satoa luvassa? Myös data kerätään jatkossa talteen
19.6.2017Mikrobit ja ilmastonmuutos
21.5.2017Suomalaisten koko perimä talteen? Datasta hyötyä tautien tutkimiseen
6.4.2017”Älyhenkivakuutuksia” tarjolla: ihmisen biologinen data hyödyttää vain oikein tulkittuna
15.1.2016Proteiinien rakenteen selvittämisen avulla uusia lääkemolekyylejä
26.10.2015BBMRI.fi: yhteinen biopankkien IT-infrastruktuuri
24.9.2015Syöpää vastaan matematiikalla
10.8.2015Saimaannorppa apuna populaatioiden perimän tutkimisessa
1.8.2015Web-mikroskooppi tallentaa kudosnäytteet pilveen
15.7.2015Mustit ja Murret ihmissairauksien geenilöytöjen takana: koirageenitutkimus hyötyy ELIXIRin tietokannoista
5.6.2015Biotiedettä eurooppalaisessa pilvessä

Immuunivälitteiset sairaudet, kuten allergiat, astma ja autoimmuunisairaudet, ovat lisääntyneet kaupungistumisen myötä. Syyksi on epäilty liian puhdasta ympäristöä, jossa menetetään kosketus luontoon ja sen mikrobeihin. Dosentti Olli Laitinen tutkii Tampereen yliopistossa mikrobialtistuksen terveysvaikutuksia. Hän on myös Uute Scientific Oy:n päätutkija. Yritys valmistaa inaktivoituja mikrobeja sisältävää uutetta, jota voidaan käyttää esimerkiksi kosmetiikassa voiteiden raaka-aineena.
Mikrobialtistusta voidaan lisätä helposti liikkumalla luonnossa ja olemalla kosketuksissa maaperän kanssa. Luontopohjaisten ja mikrobistoltaan rikkaiden materiaalien käsittely muuttaa kehon mikrobistoa. Laitisen hankkeissa tutkitaan kaupunkialueille sopivia ratkaisuja vaikuttaa immuunijärjestelmän häiriöiden yleisyyteen viherympäristöä ja kuluttajatuotteita muokkaamalla
Laitisen mielestä mikrobialtistus alkaa syntymästä.
”Kun me synnymme, meidän elimistömme ei ole immunologisesti valmis. Syntymähetkellä me käytännössä kohtaamme miljoonia erilaisia elämänmuotoja. Siinä vaiheessa immuunijärjestelmämme alkaa opiskella sitä, mikä on vaarallista ja mikä vaaratonta.”
Laitinen korostaa sitä, että perimmäinen syy nykyajan immuunivälitteisiin sairauksiin on juuri se, että olemme kadottaneet kosketuksen luontoon ja elämme liian puhtaassa ympäristössä.
”Ihminen on elänyt satoja tuhansia vuosia luonnonolosuhteissa. Ollaan synnytty eläintentaljoille, ja vauvat kiedottu kasviperäisiin materiaaleihin. Ollaan oltu heti kosketuksissa maaperään ja luontoon. Tähän altistukseen sopeuduttiin.”
”Syntymähetkellä kaikki levähtää keholle ja immuunijärjestelmä alkaa toimia. Silloin on tärkeää immuunijärjestelmälle osata erottaa mikä on vaarallista ja vaaratonta. Vaaratonta on tietenkin oma keho. Immuunijärjestelmän on myös tunnistettava, että kaikki ulkopuolelta tuleva ei ole vaarallista. Ei siis kannata synnyttää allergioita eläinten hilsettä vastaan. Immuunijärjestelmän olisi opittava, mitkä ovat oikeasti vaarallisia patogeenejä.”
Synnytys sairaalassa on varsin steriiliä luontoon verrattuna.
”Jos ollaan sellaisessa ympäristössä, jossa ei ole opetusmateriaalia paljon, niin helposti järjestelmä kokee, että kaikki ulkopuolinen on vaarallista. Tällöin syntyy allergioita ja astmaa, atooppista ihottumaa tai sitten kohdataan vielä pahempi tilanne: immuunijärjestelmä ei pysty erottamaan, mitkä ovat elimistön omia soluja, jolloin se ryhtyy tuhoamaan niitä, mikä johtaa erilaisiin autoimmuunisairauksiin.”
Lupaavia tuloksia on nyt saatu siitä, miten monimuotoinen ympäristö voi estää autoimmuunisairauksien, kuten tyypin 1 diabeteksen kehittymisen. Laitinen viittaa Tampereen yliopistossa tutkivan Noora Nurmisen väitöskirjan osatyöhön, jossa Nurminen tutki vihreän ympäristön määrää ja sen vaikutusta tyypin 1 diabeteksen kehittymiseen.
”Tyypin 1 diabetes syntyy, kun immuunijärjestelmän tulehdussolut aktivoituvat haimassa ja tuhoavat insuliinia tuottavat solut. Nurminen käytti aineistonaan 15 000 lapsen kohorttia ja tutki miten kasvuympäristö ensimmäisen elinvuoden aikana vaikutti diabeteksen kehittymiseen. Tutkimustulokset osoittivat, että agraariympäristö oli lapsille terveellinen. Maaseudulla asuville lapsille ei kehittynyt diabetesta tai siihen johtavaa autoimmuuniprosessia yhtä usein kuin kaupunkimaisissa ympäristössä eläneille lapsille tai tautiin johtava prosessi käynnistyi huomattavasti myöhemmin kuin kaupungissa asuvilla lapsilla.”
Monipuolinen mikrobisto ihmisen kehossa on vähentynyt huomattavasti, etenkin länsimaissa. Erään arvion mukaan kaupungistuneiden ihmisten iholla on jäljellä 60% alkuperäisestä mikrobistosta ja suolistossa vain 50%. Yhdysvalloissa mikrobikato on paikoin vielä suurempi. Amerikkalaisilla onkin enemmän tulehdussairauksia kuin muilla.
Olli Laitisen mielestä viimeistään siinä vaiheessa, kun lähdetään kotiin synnytyssairaalasta, pitäisi vastasyntyneen keholle saada immuunijärjestelmän koulutusta, toisin sanoen luontoaltistusta. llman altistumista luonnolle ja sen mikrobeille elimistömme immuunipuolustus ei toimi tarkoituksenmukaisesti. Kehon puolustusjärjestelmän ylireagointi voi johtaa sairauksiin. Esimerkiksi allergiassa keho tulkitsee siitepölyn virheellisesti virukseksi.
”Pohjaamme tutkimuksemme immuunijärjestelmän toimintaan ja luontoaltistuksen puutteen aiheuttamiin häiriöihin. Immunoglobluliini E:n luonnollinen tehtävä on ollut taistella loistartuntoja vastaan, mutta kun niitä on nyt huomattavasti vähemmän, IgE on vapaa agentti ja etsii uusia tehtäviä. Sellainen on esimerkiksi reagointi siitepölyyn. ”
Immunoglobuliinit eli vasta-aineet ovat valkuaisaineita, joita elimistön puolustusjärjestelmän solut tuottavat. Vasta-aineiden tehtävänä on auttaa puolustusjärjestelmää tuhoamaan tunkeilijoita, kuten bakteereita ja viruksia. IgE-luokan vasta-aineet ovat jääneet liiallisen hygienian ja steriilisyyden takia vaille luontaista aktiviteettiaan ja siten toimettomaksi. Nyt IgE-vaste aktivoituu väärin siitepölyn proteiineja kohtaan ja aiheuttaa allergisia yliherkkyysreaktioita.
Immunoglobuliini E esiintyy allergioiden ja allergisten sairauksien yhteydessä. Allergiassa elimistö tuottaa sitä esimerkiksi siitepölyä tai ruoka-aineita kohtaan. Vasta-aine kiinnittyy ihon ja limakalvojen soluihin, ja vapauttaa histamiinia. Sitten aivastellaan, henki salpautuu ja silmät muurautuvat umpeen. Kehitysmaissa, joissa loistartuntoja on yleisemmin, IgE:tä esiintyy usein korkeina pitoisuuksina ilman allergiaoireita.
Immunoglubuliinien ”väärät viholliset” on hyvä esimerkki biodiversiteetin vähenemisestä, mikä koskee myös mikrobistoa.
”Nyt kun meille myydään paljon antibakteerisia torjunta-aineita, kaikki bakteerit itse asiassa siivotaan pois. Tämä ei ole suotavaa. Olisi parempi, että meillä olisi vakiintunut mikrobiyhteisö ympärillämme, koska siiloin ei tapahdu liian isoja muutoksia.”
Muutokset mikrobistossa voivat aiheuttaa antibioottiresistenssia, joka on iso ongelma. Antibiooteille vastustuskykyiset bakteerit kantavat resistenssigeenejä ja niistä tulee usein mikrobipopulaatioissa vallitsevia.
”Patogeenit ovat nopeasti kasvavia mikrobeja. Runsas patogeenien määrä lisää geenien vaihdantaa niiden välillä, jolloin niiden vastustuskyky antibiootteja vastaan vahvistuu”, sanoo Laitinen, joka on tutkinut myös antibioottiresistenssiä.
”Toivottavasti tulevaisuudessa meillä olisi turvallinen määrä monimuotoisia mikrobeja ympäristössämme, jotta antibioottiresistentit bakteerit eivät menestyisi.”
Atooppinen ihottuma on yleinen, osin perinnöllinen tauti, jota sairastaa Suomessa noin 20–30 % väestöstä. Sen oireita ovat ihon kutina, kuivuus, karheus, punoitus ja rikkoumat. Syynä on immuunijärjestelmän poikkeava toiminta.
”Pohjoismaissa atooppinen ihottuma on yleistä. On huomattu, että monet immuunivälitteiset taudit yleistyvät populaatiotasolla pohjoista kohti mentäessä.”
Tampereen ja Helsingin yliopistojen vetämässä PREVALL-hankkeessa on tutkitttu kasvi- ja maapohjaisen materiaalin vaikutusta lasten allergisoitumiseen. Hankkeessa on myös selvitetty, pystyttäisiinkö atooppisen ihottuman kehittyminen estämään vauvaikäisillä. Tutkimukseen otettiin mukaan lapsia, joiden molemmilla vanhemmilla on todettu atooppinen ihottuma.
”Tällöin lapsella on noin 40% riski saada sama sairaus,” Laitinen huomauttaa.
Johanna Kalmarin ja Iida Mäkelän tutkimuksessa, joka on Uutteen ja Tampereen yliopiston yhteishanke, atooppiseen ihottumaan sairastuneille annettiin Uute Scientificin uutetta sisältävää mikrobivoidetta. Mikrobit eivät olleet eläviä, mutta voide sisälsi mikrobien ainesosia, joihin keho ja immuunipuolustus pystyy reagoimaan. Luontoaltistusta annettiin siis voiteen kautta. Voiteen käyttö aloitettiin loppukesästä ja syksyllä, koska talvella atoopikkojen iho on huonommassa kunnossa kuivan ilman ja lämpötilan laskun vuoksi. Myös luonnonvalon määrän vähenemisellä on vaikutusta. Voidetta käytettiin vähintään kolme kertaa viikossa. Koehenkilöistä otettiin erilaisia näytteitä ja tutkittiin ihon veden läpäisevyyttä ja punoitusta, jotka ovat tulehduksen indikaattoreita.
”Suurin ero nähtiin lääkkeen käytössä. Voidetta käyttänyt ryhmä käytti selvästi vähemmän lääkkeitä 7 kuukauden koejakson jälkeen. Voiteella pystyttiin estämään ihon huonontumista. Voide on ns. luontoaltistuslääke. Se on tukeva hoitomuoto, jotta voi käyttää vähemmän lääkkeitä.”
Uutena aluevaltauksena on, ei enempää eikä vähempää, avaruus.
”Astronautit kärsivät erilaisista iho-ongelmista. Kansainvälisellä avaruusasemalla on hyvin köyhä mikrobiympäristö, mikä ei ole yllättävää. Meidän uutettamme voitaisiin viedä avaruuteen. Keskusteluja on käyty voiteen käytöstä Euroopan avaruusjärjestön ESA:n kanssa.”
Olli Laitisen tutkimusryhmä Tampereen yliopistossa ja Uute Scientific ovat käyttäneet tutkimuksissaan Suomen ELIXIR-keskuksen CSC:n laskentapalveluja ja sensitiivisen datan palveluja. yli 10 vuotta kestäneissä Tutkimuksissa on otettu näytteitä yli 500 yksilöltä vauvoista, päiväkoti-ikäisiltä ja aikuisilta. Osa datasta on säilytetty CSC:n tietoturvallisessa ympäristössä.
Uute Scientificin mikrobiuute on valmistettu yhdistelemällä erilaisia kasvikomposteja. Se sisältää toimintakyvyttömiä mikrobeja. Näistä ei ole siis mitään harmia. Immuunijärjestelmä kuitenkin tunnistaa mikrobit, mikrobiosaset ja myös tuhotut patogeenit eli taudinaiheuttajat. Materiaali on kehitetty alun perin Helsingin ja Tampereen yliopistoissa. Se on biodiversiteetiltään ainutlaatuinen kosmetiikan ja muiden kuluttajatuotteiden raaka-aine koko maailmassa. Siinä on vähintään 600 eri mikrobilajia.
Ari Turunen
23.6.2025
Lue artikkeli PDF-muodossa