10.4.2026Aivojen kehityksen arvoitus
27.2.2026Mallinnus apuna tunnistamassa SynGAP1‑proteiinin vaihtomutaatioiden aiheuttamaa harvinaista lasten hermostosairautta
23.6.2025Liian puhdas on epäterveellistä
8.5.2025Puiden kuorista eristetyt alkaloidit tuhoavat syöpäsoluja
27.3.2025Vinka-alkaloidit: Madagaskarin lahja syövän torjuntaan
6.2.2025Geneettinen testaus parantaa lääkehoitoja
26.12.2024ComPatAI-konsortio hyödyntää suuria datamääriä oppivan tekoälymallin luomiseksi patologiaan
14.11.2024Mikrobisto vaikuttaa immuunijärjestelmään
21.10.2024Ihon monipuolinen mikrobisto auttaa immuunipuolustusta
30.9.2024RNA:ta sitovista proteiineista uusia lääkekohteita
31.8.2024Uusi koneoppimisen menetelmä nopeuttaa lääkeaineiden seulontaa satakertaisesti
22.7.2024Kahvin perimän selvittäminen parantaa taudinkestävyyttä
25.6.2024Miksi jotkut sairastuvat vaikeaan koronavirustautiin?
30.5.2024Terveysdataa ymmärtävä tekoälymalli varoittaa tulevista sairauksista
29.4.2024Genomidatalle infrastruktuuri
1.4.2024Euroopan tutkimusyhteisö valmistautuu seuraavaan pandemiaan
8.3.2024Virusten ja muiden mikrobien evolutiikka vaikuttaa ihmisen terveyteen
2.3.2024Euroopan miljoona genomia
20.2.2024Biologisen kuvadatan siirtäminen ja analysoiminen tehokkaasti web-käyttöliittymien avulla
23.1.2024Rintasyövän hoitoennuste paranee nestebiopsian avulla
15.12.2023Euroopan terveysdata-avaruus: terveysdata liikkuu tutkimuskäyttöä varten yli rajojen
16.11.2023Suolistomikrobien toimintaa mitataan uudella menetelmällä
31.10.2023Kasvien mikrobikumppanit kaivosjätteiden puhdistajana
29.9.2023Tekoäly etsii sopivan lääkeaineen geenidatasta ja syöpäsolunäytteistä
1.9.2023Dataa eri lähteistä yhdistämällä saadaan yksilöllisiä hoitoja
15.8.2023Leukemiaan parempia hoitoja
10.6.2023Mikro-RNA:t voivat paljastaa nuoruusiän diabeteksen
16.5.2023Yksittäisen solun sekvensointitekniikka mahdollistaa sairauksien yksilöllisen hoidon
12.4.2023Kudosnäytteet, jotka on analysoitu sensitiivisen datan (SD) palveluilla, antavat uutta tietoa keliakiasta ja muista autoimmuunisairauksista
20.3.2023Itämeren sedimenteistä eristetyt DNA:t auttavat tutkimaan ilmastonmuutosta ja biodiversiteettiä
27.2.2023Kantasoluista kasvatetut organoidit tehostavat syöpätutkimusta
19.12.2022Sensitiivisen datan palvelut tutkimukselle: muutamalla klikkauksella tutkija voi käynnistää turvallisen ja henkilökohtaisen laskentaympäristön
30.11.2022Ikiroudan alta paljastui mikrobiyhteisöjä, joilla on merkittävä rooli ilmastonmuutoksessa
20.10.2022Uudelleenkäytettävää, oikein kuvattua ja laadukasta dataa – tutkijayhteisön luomia työkaluja ketterään datanhallintaan
29.9.2022Valtamerien mikrobiyhteisöjen rakennetta ja toimintaa selvitetään geenisekvensoinnin avulla
1.9.2022Antibiooteille vastustuskykyiset bakteerit ovat maailmanlaajuinen ongelma
23.8.2022Yksilöity lääketiede syövän ja virusten torjunnassa
30.6.2022Ihmisen mikrobiomin tutkiminen on avain terveyden kokonaisvaltaiselle ymmärtämiselle
23.5.2022FINRISKI: yksi maailman pisimmistä väestötutkimuksen aikasarjoista
8.4.2022Biopankkien ja terveysrekisterien tiedon yhdistäminen mahdollistaa personoidun hoidon kehittämisen
3.3.2022Suomessa sekvensoidaan tuhansien diabetes-potilaiden koko perimä ja etsitään geneettisiä riskitekijöitä
10.2.2022BIGPICTURE mahdollistaa patologian muuttumisen digitaaliseksi
30.12.2021Sensitiivisen datan infrastruktuuri
23.11.2021Tulevaisuudessa algoritmi voi tunnistaa glaukooman silmänpohjakuvista
26.10.2021Potilasdatan ansiosta saadaan entistä parempia tekoälymalleja
16.9.2021Algoritmi opetetaan tunnistamaan syöpä sekvenssidatasta
3.12.2020Tehokas datan prosessointi ja jakaminen parantaa sairauksien tunnistamista ja hoitoa
10.11.2020Bioinformatiikka mullistaa terveydenhuollon: Datan tehokas käsittely nopeuttaa diagnooseja ja mahdollistaa yksilölliset lääkehoidot
27.8.2020Kudosnäytteet digitaalisiksi kuviksi ja tekoäly tulkitsemaan
9.6.2020Digitaalinen patologia nopeuttaa diagnosointia
18.5.2020Koneoppimisella etsitään merkkejä rintasyövästä
8.4.2020Metabolomiikka mittaa ja analysoi sairauden, ruokavalion tai lääkityksen aiheuttamia muutoksia aineenvaihdunnassa
1.3.2020Syväoppimisalgoritmit auttavat rintasyövän seulonnassa
13.2.2020Rintasyövän kaikkia riskitekijöitä arvioidaan tekoälyn avulla
6.2.2020Koira haistaa sairauksia
2.12.2019ELIXIR Compute Platform -laskentaympäristö bio- ja terveystieteille
18.11.2019Bioinformatiikan uudet menetelmät ja tekniikat edellyttävät jatkuvasti päivittyvää kurssitarjontaa ja analyysiohjelmistoja
30.10.2019Käyntiä tiskillä ei tarvita: SisuID tehostaa sähköistä tunnistamista
30.9.2019Sydän- ja verisuonitautien riskiarviointi kaikille kansalaisille
4.9.2019Verisuonten mallintamisella täsmähoitoa laskimosairauksiin
20.8.2019Federoitu käyttäjähallinta: yhdellä tunnistautumisella lukuisiin bioinformatiikan palveluihin
4.7.2019Harvinainen geeniperimä auttaa löytämään yleisiä tauteja ohjaavia mekanismeja
3.6.2019VEIL.AI: potilastietoja hunnutettuina
20.5.2019Biocenter Oulu: teknologiapalveluja biolääketieteelliseen tutkimukseen
23.4.2019Hiirimalleista apua ihmisten tautien syntymekanismien selvittämiseen
4.3.2019Euro-BioImaging: kuvantamisen infrastruktuuri
26.2.2019Kuvantaminen auttaa havainnoimaan datan merkitystä
14.1.2019Datan harmoniaa ja standardeja: aineistot pitää käsitellä, kuvailla ja tallentaa samalla tavoin
10.12.2018Sadat geenit voivat olla yksittäisen taudin taustalla
5.11.2018Suomalaisen väestön perimästä apua sydän- ja verisuonisairauksien hoitoon
8.10.2018Sairauksien ennustemallit tarkentuvat laskennallisten menetelmien ansiosta
11.9.2018Geenidata haltuun ja haluttuun muotoon
23.8.2018Massiivinen datanhallintaprojekti: suomalaisten perimä kerätään talteen
14.6.2018Puolet lääkeaineista vaikuttaa vain kolmeen proteiiniperheeseen
12.6.2018Hyvää lääkeainemolekyyliä etsimässä
29.5.2018Potilasnäytteistä nopea DNA-analyysi tekoälyn avulla
7.5.2018Suoliston salaisuudet
4.4.2018Algoritmi määrittää sopivan lääkkeen
19.3.2018Miljoonan potilasnäytteen pankki
20.2.2018Kaikkien eliöiden perimän selvittäminen mahdollistaa uusia rokotteita ja lääkkeitä
7.2.2018Tilattu ja lukkojen takana
2.11.2017Tavoitteena kansallinen palvelu perimästä saadun datan hyödyntämiseen terveydenhuollossa
11.8.2017Parempaa satoa luvassa? Myös data kerätään jatkossa talteen
19.6.2017Mikrobit ja ilmastonmuutos
21.5.2017Suomalaisten koko perimä talteen? Datasta hyötyä tautien tutkimiseen
6.4.2017”Älyhenkivakuutuksia” tarjolla: ihmisen biologinen data hyödyttää vain oikein tulkittuna
15.1.2016Proteiinien rakenteen selvittämisen avulla uusia lääkemolekyylejä
26.10.2015BBMRI.fi: yhteinen biopankkien IT-infrastruktuuri
24.9.2015Syöpää vastaan matematiikalla
10.8.2015Saimaannorppa apuna populaatioiden perimän tutkimisessa
1.8.2015Web-mikroskooppi tallentaa kudosnäytteet pilveen
15.7.2015Mustit ja Murret ihmissairauksien geenilöytöjen takana: koirageenitutkimus hyötyy ELIXIRin tietokannoista
5.6.2015Biotiedettä eurooppalaisessa pilvessä
Aivotutkija Jetro Tuulari on kiinnostunut melkein kaikesta mikä vaikuttaa lapsen aivojen kehitykseen. Niinpä hän tarvitsee isoja aineistoja ja paljon laskentatehoa.

Pieni poika kokee lapsuudessaan kovia. Häntä kohdellaan kaltoin. Hän ahdistuu ja stressaantuu.
Vuosikymmeniä myöhemmin pojasta tulee isä. Lapsuuden stressi on vaihtunut rauhallisempaan aikuisuuteen, mutta silti se on voinut jättää ylisukupolvisen merkkinsä. Kaltoinkohtelukokemusten todettiin olevan yhteydessä vastasyntyneen lapsen valkean aineen korkeampaan eheyteen, joka yleensä liittyy aivojen varhaiseen kehitykseen.
Onko isän lapsena kokema stressi ehkä nopeuttanut aivojen kehitystä? Ja mitä tämä mahdollisesti voisi tarkoittaa?
Nopeasti ajateltuna syy-seuraussuhde isän vanhojen kokemusten ja vastasyntyneen aivojen välillä kuulostaa liki uskomattomalta. Kyse ei voi olla perimästä: isän perimä on lyöty lukkoon jo ennen hänen lapsuuttaan. Lapsen alkuun pannut siittiö taas on muodostunut kauan lapsuuden ahdistuksen jälkeen.
Mekanismia tai merkitystä myöhemmälle kehitykselle ei vielä ymmärretä, mutta yhteys oli selvästi havaittavissa sekä vastasyntyneen aivoihin että toisessa tutkimuksessa siittiöiden epigenetiikkaan, kertoo aivotutkija Jetro Tuulari. Hän vetää Turun yliopistossa lasten aivojen kehitystä laajoilla aineistoilla kartoittavan FinnBrain-tutkimuksen aivokuvantamisen osatutkimusryhmää.
FinnBrain-tutkimus on Turun yliopistossa vuonna 2010 aloitettu tutkimus, jonka tarkoituksena on selvittää ympäristön ja perimän vaikutusta lapsen kehitykseen ja terveyteen. Sen taustalla piilee yksilönkehityksen suuri kysymys: kumpi merkitsee enemmän, perimä vai ympäristö?
Lähtökohdasta on kuitenkin edetty moneen suuntaan. Kuten esimerkiksi isiin.
”Minulla on vähän tapana lähteä rönsyilemään tutkimusaiheiden kanssa. Kuten vaikka aivoista siittiötutkimukseen” Tuulari kertoo.
Aivotutkija Jetro Tuulari työskentelee Turun yliopistossa FinnBrain-tutkimuksen aivokuvantamisen tutkimusryhmässä.
Isätutkimus on vain yksi monista Tuularin kiinnostuksen kohteista. Niitä yhdistävät aivokuvantaminen ja suuret aineistot.
FinnBrainissa hänen tärkein tutkimusaineistonsa on noin 4 000 varsinaissuomalaisen ja ahvenanmaalaisen perheen tutkimusryhmä, josta on aivokuvattu noin 200 lapsen kohortit kahden viikon, viiden vuoden ja 10–11 vuoden iässä. Toiveena olisi kuvata uusi ikäpiste lähivuosina, tutkittavien ollessa ehkä 16 tai 17, riippuen siitä, mihin saadaan rahoitusta.
FinnBrain-tutkimuksen aineiston lisäksi Tuulari käyttää suuria ulkomaisia aineistoja, esimerkiksi yhdysvaltalaista Adolescent Brain Cognitive Developmentin aineistoa, jossa on aivokuvattu 12 000 ihmistä joka toinen vuosi.
Silti hän haluaisi yhä suurempia aineistoja.
”Toivoisin pääseväni tuhansien ihmisten aineistoista kymmenien tuhansien aineistoihin.”
Tällainen vaatii erilaisten, ympäri maailmaa kerättyjen aivokuvantamisaineistojen yhtenäistämistä ja yhdistelemistä. Apuna käytetään tekoälyä, joka voi tarvittaessa paikata aineistojen puutteita terävöittämällä kuvien resoluutiota valmiiden mallien pohjalta.
Suuret aineistot mahdollistavat monenlaiset tutkimuskysymykset ja luotettavampia tutkimustuloksia. Väitöksestään lähtien Tuulari on ollut kiinnostunut lasten aivojen ja painon kehityksen yhteydestä. Tuoreimmassa tutkimuksessa hän havaitsi kiinnostavan korrelaation: aivoissa on erilaisia toiminnallisia hermoverkkoja, jotka aktivoituvat ja menevät päälle yksilöllisesti vaihtelevilla nopeuksilla. Näiden aivoverkkojen uusilla menetelmillä määritetyt dynaamiset muutokset 9–10-vuotiaana liittyvät lapsen painonnousuun myöhemmin teini-iässä.
”Dynaamisuudesta kertovat muuttujat eivät selitä koko ilmiötä, vaan sen selitysvoima painon osalta on noin 20 prosentin luokkaa. Se on kuitenkin selvästi enemmän kuin aiemmin raportoiduilla toiminnallisen kuvantamisen selitysmalleilla.”
Siitä, miksi verkostojen dynaamisuus vaikuttaa painonnousuun, tutkimus ei vielä kerro. Mahdollisia hypoteeseja voivat olla yllykkeiden säätelyn tai näläntunteen erot.
”Silti sillä voisi olla merkitystä esimerkiksi riskiryhmien tunnistamisessa”, Tuulari kertoo.
Toinen Tuularia viime aikoina kiinnostanut asia on aivojen koon kehitys vastasyntyneestä aikuisuuteen yhteistyössä Cambridgen ja Pennsylvanian yliopiston tutkijoiden ja heidän johtamansa kansainvälisen konsortion kanssa.
”Ideana on määrittää kasvukäyrän hieman samaan tapaan kuin vaikka pituudelle”, Tuulari kertoo.
”Että jos vastasyntyneen aivot kuvataan, voidaanko kuvasta päätellä, minkä kokoiset aivot nuorella on aikuisena.”
Kysymys ei ole ihan suoraviivainen. Aivojen kasvuun alakouluiässä näyttäisi liittyvän samanlainen kasvupyrähdys kuin pituuteen teini-iässä: jos aivot kasvavat nopeasti lapsuudessa ja esiteininä, voi kasvu tyssätä siihen, kun taas hitaammin kasvavista aivoista voi tulla suuremmat.
Mutta mitä merkitystä aivojen kasvuennusteella sitten olisi? Olisiko ajatuksena seuloa todennäköisesti isoaivoisimmat jo varhaislapsuudessa?
”Ei ole tässä vaiheessa”, Tuulari vakuuttaa. Edes aivojen koon suhde älykkyyteen ei ole yksinkertainen, vaikka esimerkiksi muistisairaudet aivoja kutistavatkin. Esimerkiksi pikkulapsilla isojen aivojen on todettu lisäävän autismin riskiä.
”Ensisijaisesti tämä on perustutkimusta. Mutta hieman neuvolan kasvukäyrän tapaan ennuste olisi yksi tapa seurata kehitystä ja antaa mahdollisuus huomata, jos kehitys ei mene odotusten mukaan. Aivojen kasvukäyrät toivottavasti johtavat kliinisiin sovelluksiin.”

Tutkimuksessaan Tuulari käyttää suuria aineistoja, joissa on paljon dataa. Tyypillistä tutkimusaineistoa ovat kolmiulotteiset aivokuvat, joissa on valtavasti informaatiota. Ja näitä tarvitaan mieluiten kymmeniä tai satoja tuhansia.
Läheskään kaikki ohjelmistot eivät pysty käsittelemään kuvia. Niinpä Tuulari on yhdessä tietojenkäsittelytieteen tohtorin Harri Merisaaren kanssa kehittänyt tapaa muuttaa aivokuvia taulukkomuotoon. Yksi kolmiulotteinen aivokuva muutetaan tauluksi, jossa on noin 192 000 solua. Tämä uusi tiedostomuoto mahdollistaa useat sovellukset. Jos taas seurataan aivojen toimintaa, kuvia otetaan 1–3 sekunnin välein ja kuvauksen pituus voi olla jopa 10 minuuttia. Niinpä yhdestä kolmiulotteisesta kuvasarjasta tulee 4 800 000 datapistettä.
Kun vertailussa voi olla tuhansia ja tuhansia aivokuvia, nousee datapisteiden määrä nopeasti. Niinpä laskemiseen tarvitaan supertietokoneita.
Tuulari kertoo käyttävänsä työssään sekä Cambridgen yliopiston supertietokonetta että CSC Tieteen tietotekniikan keskuksen Puhti-konetta. Kummassakin on puolensa.
”Cambridgen palvelimella jonotusajat ovat lyhyemmät, mutta CSC:n palveluiden kanssa asioiminen on monella tapaa mutkattomampaa. Aineistojen lisäksi tarvitsemme usein meitä varten optimoituja ohjelmistoja. Niiden saaminen supertietokoneelle ei aina ole ihan helppoa, mutta CSC on ollut näissä todella joustava.”
Mutta entä se suurin kysymys? Mihin johtopäätökseen Tuulari on päässyt valtavien aivokuvantamisaineistojen, vuosikymmeniä pitkien seurantatutkimusten ja oman FinnBrain-aineistonsa pohjalta? Kumman merkitys on suurempi, perimän vai ympäristön?
Tutkimuksessa näkyy merkkejä molemmista. Perimä vaikuttaa lapsen kehitykseen, mutta esimerkiksi tulos isän kaltoinkohtelun vaikutuksesta lapsen aivoihin osoittaa, että ympäristö voi vaikuttaa jopa sukupolvien yli.
Silti Tuularin oma arvio painaa vaakakupin perimän puolelle.
”Ajattele vaikka, miten monimutkainen elin aivot ovat. Kun sikiö kehittyy, koko ohjelma aivojen rakentamiseen on siellä perimässä, koodattuna DNA:sta syntyvien aminohappojen ketjuun. Se on suoranainen ihme.”
”Perimässä on ohje siitä, mikä on käden muoto ja millaiset ovat toimivat aivot. Ja ne tiedot ovat meillä jo syntymässä. Siksi geenit ovat nähdäkseni lapsen aivojen kehityksessä ykkössijalla. Me aikuiset sitten voimme toki elämäntavoillamme vaikuttaa paljonkin siihen, miten niiden pohjalta pärjäämme.”
Teksti, Tuularin valokuva ja video: Juha Merimaa
10.4.2026
Lue artikkeli PDF-muodossa